普通网站查重和知网查重的区别主要在于应用领域和技术要求上的不同。普通网站查重通常用于检测网页内容的原创性和重复率，以保证网站内容的质量和排名。而知网查重则是专门针对学术文献的查重工具，对于学术领域的文献查重更加精准和专业。

另外，普通网站查重通常使用的是普通的查重工具，如网页去重插件或在线查重工具，而知网查重则需要专门的学术查重系统，如知网查重系统。此外，知网查重还会结合学术规范和引用标准进行查重比对，确保学术文献的准确性和可信度。因此，普通网站查重和知网查重在应用场景、技术要求和精准度上存在明显差异。